依计找到ダグ，他帮助丽莎见到了国王。在国王处得到情报母亲很可能去了圣城，丽莎在王城体息了一晚就上路了。在圣城门口经过卫兵的盘问（先选二，后选一）进人灵城向ソ一マ打听后，向南行进入圣城森林，修行场中见到一个极似母亲的女人，但很快她就被魔兽杀死了。丽莎只得再回圣城，这次必须跟ソ一マ交手才能通关。过圣城森林后，一只巨大的方舟阻碍着道路，这次又遇见丹恩，双方身上都有宝石，产生了共鸣，丹恩驾方舟走了。在言灵山见到佐拉，得知身上的宝石是通行世界末日的钥匙。在瀑布下方的房子中，丽莎可学到强大魔法。再与佐拉对话时，众人落入了冥河，在亡灵等候登上摆搜船时，丽莎跟两个地狱使者产生了冲突。一怒之下将它们打跑强行上了船，在行船途中救了一个叫玛丽娜（マリ一ナ）的水柄族女子，她一看见丽莎却跑了。
继续渡河，忽然四周一片漆黑。有人在叫丽莎的名字，这时连续“このまま、じつとしてる”可避开鬼物的袭击，等待真正的母亲亡灵出现，可得到宝物。落在一岸边，又见到玛丽娜，她加入了队伍。丽莎四人在ブルスティの间打败了魔兽ブルスティの，它会变成果实种子。
回到地上，是古代遗迹，把圣杯放回原位从遗迹出来碰到假沙尼朵。出遗迹北行到污染地带将种子植入地穴中，完成了大地净化进程。
途经收容所，来到ソトムの废城碰见了真沙尼朵，告诉他时在哪里找到自己的躯体。出来时，天空大陆落在地上。向上来到ロマ町，玛丽娜碰见了同类，将守神之卵投进水源，暂时与丽莎分开了。丽莎来到污染都市ゴモラ，启动一个开关后，可使用电梯，在地下皮皮和伽来路被吸进屏幕。这时丽莎在屏幕外可看见两人的梦境，只有做对了，两人才能获救，三人合力打败了魔物ラウメ一ン，得到宝物マザ一エナジ一。
在ソドムの废城，在一间桌上有大钥匙的屋里，朝水坛里察看可进入秘室。读到一本神秘手记，这期间五个亡灵进来向丽莎三人发动了攻击（每回只有一个亡灵的头微微动，全 力攻击可轻易过关），战后可拿到大钥匙。回污染都市进入先前地下室锁 着的门，在屋里按顺序，“月左回，星左回，太阳右回”开动了装置，出门向右的屋里有了通往深海的路。
海底ピラミッド，玛丽娜加入，在迷宫必须踏动三个踏板。来到海下ラィラの町，长老指点迷津，丽莎利用鱼类帮助在海洋中可自由来往于各大陆。这时的登陆地点有几个都很难找，你要细心地在地图上寻找，在一处登陆后可来到迷之森，见到长老和西昂等人，又拜见了町の南口传师，得到遗迹钥匙，回登陆点打开遗迹的封闭大门，唤醒了メイフア丽莎去北大陆。从海底来到西大陆言灵山见佐拉后，回北大陆カ一ン町，见过自己的祖父，在町左下角坐上船来到女神像岛上，在这打败メイフア，它带众人来到了“月”星球。
在这个先进文明造就的机械基地，处处是陷井，丽莎一行四人经受了最严峻的考验。攻关要点是地阁两侧有二个扳关，中间有一按钮，两个扳关不动，按按钮可去一处；两个扳 关启动，按按钮可到一处，其中奥妙请玩家定夺。生命的进程是遵循大自 然法则，各种种族的生与灭无法自己控制，自然的法则决定人间族的衰亡，新崛起的祖族正在翘首企盼。可人类太强大，亲手改变了自己的命 运，让人间族继续昌盛下去。
一切似乎结束了！站在メイフア面前。丽莎惊愕地听说人类必须还要战胜这宇宙的造物主，被选中的第四个人类勇士将出现在女神像脚下右边的门里，他是谁……
最终之章
第十六天，世界一流盗贼丹恩在方舟上与伙伴キツト开怀大笑，原来丹恩想聚齐鲁多拉秘宝的十种法器的凤愿已经完成。此时ミトラ现身，向这第四位勇者说明了一切。丹恩在海底遇见了沙尼朵和西昂，三人辞别伙伴飞向“月”星球。丽莎早已等候于此，四人同心协力迎接历史的考验，真正的恶战开始。“过去之门ウルス”，四个种族的鲁多拉守护者和ハウゼン一一被打败。“未来之门スクルト”，进去后一直向前走 可过关，不要踏地上通气孔，如果向后走，会进入一个死角，必须打败四个宝箱怪物才能出
